يتطلع قسم أمراض النبات لتأهيل طلاب الكلية للحصول علي درجة البكالوريوس والماجستير والدكتوراه وإعدادهم الإعداد الجيد الذي يؤهلهم للمنافسة في سوق العمل محلياً وإقليمياً كما يتطلع القسم لإجراء البحوث التطبيقية اللازمة لحل المشكلات المرضية بشكل يحافظ علي سلامة البيئة وسلامة المنتجات الزراعية من التلوث.